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Les deux grands centres de la culture Yayoi sont le nord du Kyûshû et le Kinai ou région centrale. Dans le premier on retrouve un plus grand nombre d'armes rituelles en bronze. Au centre du Honshû on trouvera d'avantage de dôtaku, les "cloches" de bronze, qui présentent des scènes de chasse ou de la vie quotidienne et donnent une iconographie seule capable d'informer les chercheurs sur l'environnement matériel et naturel des hommes d'alors. Sur les sites Yayoi on été également retrouvées des magatama (曲玉), des petites perles en forme de canine ou de goute d'eau courbée, que l'on pense avoir servi d'amulette. Ces magatama, que l'on trouve également à la même époque en Corée sont mentionnées dans des chroniques historiques comme le Kojiki (古事記) ou le Nihonshoki (日本書紀), en tant que siège de certains kami. 　　L'Est n'a été atteint que plus tardivement et la culture Jômon s'y est maintenue plus longtemps.